霍华德·休斯医学研究所

作为霍华德·休斯医学研究所的一名软件工程师，我致力于一款名为 CATMAID 的协作神经元重建和分析软件1 2 （截图：3），该软件用于神经科学研究。我们使用 PostGIS 在 3D 空间中表示神经元。

它们由 3D 点组成，这些点引用其父节点，或者如果没有父节点，则为根 [=神经元的胞体]。它们与突触、点云和 TIN 网格一起用于模拟数据集中的隔室，从而模拟我们神经科学世界的空间方面。用户以协作方式手动创建这些神经元重建，此外，分割程序可以用作其他数据源。借助其空间索引，PostGIS 可以帮助我们快速查询特定视野中的神经元。单个项目的空间有时包含数亿个相互连接的单独点。我们还在神经元和隔室网格之间进行边界框相交查询，然后在前端通过执行更精确的相交测试进行细化。

这款软件被相当多的研究实验室使用，据我所知，他们都使用专用服务器进行自己的托管，这也是我们所做的。主要原因是，对于较大的数据集，我们受益于拥有大量 RAM（>256G）、快速 SSD/NVMe 驱动器和许多 CPU，以及用于例如图像数据的快速本地数据访问的机器。

非常感谢您使 PostGIS 在非 GIS 环境中也能良好运行——这让我的生活轻松多了！